현미경 영상 분할을 위한 Cellpose
Medical Imaging Toolbox™ Interface for Cellpose Library 지원 패키지를 사용하여 현미경 영상에서 세포를 분할합니다. 이 지원 패키지는 Cellpose Library에서 사전 훈련된 모델을 다운로드하고, Cellpose 모델을 사용하여 2차원과 3차원 영상을 분할하며, 사용자의 고유한 현미경 데이터를 사용하여 새 모델을 훈련시키는 기능을 제공합니다.
애드온 탐색기에서 Medical Imaging Toolbox Interface for Cellpose Library를 설치할 수 있습니다. 애드온 설치에 대한 자세한 내용은 애드온을 받고 관리하기 항목을 참조하십시오. 이 지원 패키지를 사용하려면 Deep Learning Toolbox™와 Computer Vision Toolbox™도 필요합니다.
함수
cellpose | 세포 분할에 사용할 Cellpose 모델 구성 (R2023b 이후) |
segmentCells2D | Cellpose를 사용하여 2차원 영상 분할 (R2023b 이후) |
segmentCells3D | Cellpose를 사용하여 3차원 영상 볼륨 분할 (R2023b 이후) |
trainCellpose | 사용자 지정 Cellpose 모델 훈련 (R2023b 이후) |
downloadCellposeModels | Download pretrained models from Cellpose Library (R2023b 이후) |
도움말 항목
- Cellpose 시작하기
사전 훈련된 Cellpose 모델을 사용하여 현미경 영상에서 세포를 분할하거나, 사용자 지정 모델을 훈련시킵니다.
추천 예제
세포 분할에 사용할 사전 훈련된 Cellpose 모델 선택하기
이 예제에서는 사전 훈련된 Cellpose 모델을 사용하여 현미경 영상에서 세포를 분할하는 방법을 보여줍니다.
Refine Cellpose Segmentation by Tuning Model Parameters
Explore and tune Cellpose parameters to improve segmentation results.
Detect Nuclei in Large Whole Slide Images Using Cellpose
Detect cell nuclei in whole slide images (WSIs) of tissue stained using hematoxylin and eosin (H&E) by using Cellpose.
Classify Tumors in Digital Pathology Images Using Cell Nucleus Morphology
Classify whole slide image (WSI) patches as normal or cancerous using pathomics.
Train Custom Cellpose Model
Train a custom Cellpose model, using new training data, to detect noncircular shapes.
