현미경 영상 분할을 위한 Cellpose

Medical Imaging Toolbox Interface for Cellpose Library를 사용하여 현미경 영상을 분할

Medical Imaging Toolbox™ Interface for Whole Slide Imaging File Reader 지원 패키지를 사용하면 OpenSlide 라이브러리와 Bio-Formats 라이브러리를 사용해 크기가 큰 현미경 영상 파일을 가져와 분할할 수 있습니다. Medical Imaging Toolbox Interface for Cellpose Library 지원 패키지를 사용하여 현미경 영상에서 세포를 분할합니다. 이 지원 패키지는 Cellpose Library에서 사전 훈련된 모델을 다운로드하고, Cellpose 모델을 사용하여 2차원과 3차원 영상을 분할하며, 사용자의 고유한 현미경 데이터를 사용하여 새 모델을 훈련시키는 기능을 제공합니다. 이 지원 패키지를 사용하려면 Deep Learning Toolbox™와 Computer Vision Toolbox™도 필요합니다. 애드온 탐색기에서 지원 패키지를 설치할 수 있습니다. 애드온 설치에 대한 자세한 내용은 애드온을 받고 관리하기 항목을 참조하십시오.

함수

모두 확장

openslideinfoRead whole slide image file metadata using OpenSlide library (R2026a 이후)
openslidereadRead whole slide image data using OpenSlide library (R2026a 이후)
bioformatsinfoRead whole slide image file metadata using Bio-Formats library (R2026a 이후)
bioformatsreadRead whole slide image data using Bio-Formats library (R2026a 이후)
cellpose세포 분할에 사용할 Cellpose 모델 구성 (R2023b 이후)
segmentCells2DCellpose를 사용하여 2차원 영상 분할 (R2023b 이후)
segmentCells3DCellpose를 사용하여 3차원 영상 볼륨 분할 (R2023b 이후)
trainCellpose사용자 지정 Cellpose 모델 훈련 (R2023b 이후)
downloadCellposeModelsDownload pretrained models from Cellpose Library (R2023b 이후)

도움말 항목

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