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niftiwrite

NIfTI 형식을 사용하여 파일에 볼륨 쓰기

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구문

niftiwrite(V,filename)
niftiwrite(V,filename,info)
niftiwrite(V,filename,info,Name,Value)

설명

예제

niftiwrite(V,filename)은 NIfTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative) 형식을 사용하여 볼륨 영상 데이터 V를 파일에 씁니다. 기본적으로 niftiwrite는 메타데이터와 볼륨 데이터를 모두 포함하는 결합된 NIfTI 파일을 만듭니다. niftiwrite는 파일 filename을 명명하며 .nii 파일 확장자를 추가합니다. niftiwrite는 적절한 디폴트 값과 볼륨 속성(예: 크기 및 데이터형)을 사용하여 메타데이터를 채웁니다.

niftiwrite는 NIfTI1과 NIfTI2 파일 형식을 모두 지원합니다. NIfTI1이 디폴트 파일 형식입니다. NIfTI2 형식으로 NifTI 데이터를 쓰려면 Name,Value 쌍 인수를 사용하는 구문을 사용하십시오. Version 인수를 'NIfTI2'로 지정하십시오.

예제

niftiwrite(V,filename,info)는 info의 파일 메타데이터를 포함해 볼륨 데이터 V를 파일에 씁니다. 메타데이터가 영상 콘텐츠 및 크기와 일치하지 않으면 niftiwrite는 오류를 반환합니다.

niftiwrite(V,filename,info,Name,Value)는 Name,Value 쌍에 지정된 옵션을 사용하여 파일에 볼륨 데이터를 씁니다.

예제

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라이브 스크립트 열기

.nii 파일 이름을 사용하여 NIfTI 영상을 불러옵니다.

V = niftiread('brain.nii');

3×3 중앙값 필터를 사용하여 3차원 영상을 필터링합니다.

V = medfilt3(V);

디폴트 헤더 값을 사용하여 .nii 파일에 필터링된 영상을 씁니다.

niftiwrite(V,'outbrain.nii');
라이브 스크립트 열기

.nii 파일 이름을 사용하여 NIfTI 파일에서 메타데이터를 읽어 들입니다.

info = niftiinfo('brain.nii');

파일 메타데이터를 사용하여 파일에서 볼륨 데이터를 읽어 들입니다.

V = niftiread(info);

파일의 Description 메타데이터 필드를 편집합니다.

info.Description = 'Modified using MATLAB R2017b';

수정된 메타데이터와 함께 볼륨 데이터를 새 .nii 파일에 씁니다.

niftiwrite(V,'outbrain.nii',info);

입력 인수

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NIfTI 파일 이름으로, string형 스칼라 또는 문자형 벡터로 지정됩니다. 기본적으로 niftiwrite는 메타데이터와 영상 데이터를 모두 포함하고 파일 확장자가 .nii인 결합된 형식 파일을 만듭니다. 'Compressed' 이름-값 쌍을 지정하면 niftiwrite가 파일 확장자 .nii.gz를 추가합니다. 'Combined' 이름-값 쌍을 false로 설정하면 niftiwrite는 이름은 같고 파일 확장자가 다른 파일 두 개를 만듭니다. 한 파일에는 볼륨과 연결된 메타데이터가 포함되고 파일 확장자는 .hdr입니다. 다른 파일에는 영상 데이터가 포함되고 파일 확장자는 .img입니다.

데이터형: char | string

볼륨 데이터로, 숫자형 배열로 지정됩니다.

데이터형: single | double | int8 | int16 | int32 | int64 | uint8 | uint16 | uint32 | uint64 | logical

파일 메타데이터로, niftiinfo 함수에서 반환된 구조체로 지정됩니다.

데이터형: struct

이름-값 인수

선택적 인수 쌍을 Name1=Value1,...,NameN=ValueN으로 지정합니다. 여기서 Name은 인수 이름이고 Value는 대응값입니다. 이름-값 인수는 다른 인수 뒤에 와야 하지만, 인수 쌍의 순서는 상관없습니다.

R2021a 이전 릴리스에서는 쉼표를 사용하여 각 이름과 값을 구분하고 Name을 따옴표로 묶으십시오.

예: niftiwrite(V,'outbrain.nii','Compressed',true)

생성할 NIfTI 파일의 유형으로, true 또는 false로 지정됩니다. true(디폴트 값)이면 niftiwrite는 파일 확장자가 .nii인 단일 파일을 만듭니다. false이면 niftiwrite는 이름은 같지만 파일 확장자가 다른 파일의 쌍을 만듭니다. 메타데이터를 포함하는 파일의 확장자는 .hdr이며 볼륨 데이터를 포함하는 파일의 확장자는 .img입니다.

데이터형: single | double | int8 | int16 | int32 | int64 | uint8 | uint16 | uint32 | uint64 | logical

영상 데이터를 압축할지 여부로, true 또는 false로 지정됩니다. 'Compressed'가 true이면 niftiwrite는 gzip을 사용하여 파일 이름 확장자가 .gz인 압축된 파일을 생성합니다.

데이터형: single | double | int8 | int16 | int32 | int64 | uint8 | uint16 | uint32 | uint64 | logical

데이터의 엔디안으로, 리틀 엔디안 형식(디폴트 값)을 나타내는 'little' 또는 빅 엔디안 형식을 나타내는 'big'으로 지정됩니다.

데이터형: char | string

NIfTI 데이터 형식으로, 'NIfTI1' 또는 'NIfTI2'로 지정됩니다.

  • 'NIfTI1'로 지정되면 niftiwrite는 NIfTI1 데이터 형식에 따라 입력값을 씁니다.

  • 'NIfTI2'로 지정되면 niftiwrite는 NIfTI2 데이터 형식에 따라 입력값을 씁니다.

  • 지정하지 않으면 'Version'의 디폴트 값이 입력 볼륨 데이터의 최대 차원을 기반으로 선택됩니다.

    • 입력값의 최대 차원이 32767보다 작거나 같으면 디폴트 값은 NIfTI1입니다.

    • 입력값의 최대 차원이 32767보다 크면 디폴트 값은 NIfTI2입니다.

데이터형: char | string

참고 문헌

[1] Cox, R. W., J. Ashburner, H. Breman, K. Fissell, C. Haselgrove, C. J. Holmes, J. L. Lancaster, D. E. Rex, S. M. Smith, J. B. Woodward, and S. C. Strother. "A (sort of) new image data format standard: NiFTI-1." 10th Annual Meeting of Organisation of Human Brain Mapping, Budapest, Hungary, June 2004.

버전 내역

R2017b에 개발됨

참고 항목

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