"ノンスティッフ方程式の求解" や "時間依存の項をもつ ODE" のサンプルコードは 2 次元連立微分方程式を解いています。まずはこちらを参考にして頂くとよいかと思います。
N次元連立微分方程式のMATLABでの解法コード
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