1次元信号の内挿でしたらinterp1で行えます。
下のサンプルはsin波を異なる時間でサンプリングしたときの例となります。
t1 = sort(rand(1,20)).*2*pi;
t2 = sort(rand(1,15)).*2*pi;
y1 = sin(t1);
y2 = sin(t2);
figure
plot(t1,y1,'or-',t2,y2,'ob-');
title('original simulated data');
legend('y1', 'y2');
y1_ = interp1(t1, y1, t2);
figure;
plot(t2, y1_, 'or-', t2, y2, 'ob-')
title('resampled result')
legend('resampled y1 at t2', 'y2')