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matlab.unittest.constraints.Tolerance 클래스

패키지: matlab.unittest.constraints

허용오차에 대한 인터페이스

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설명

matlab.unittest.constraints.Tolerance 클래스는 허용오차에 대한 인터페이스를 제공합니다. 허용오차는 주어진 데이터형에 대한 대략적인 동일성 개념을 정의하고 Within 이름-값 인수를 사용하는 특정 비교 연산자뿐 아니라 IsEqualTo 제약 조건에도 적용할 수 있습니다.

이 클래스에는 세 가지 추상 메서드가 있습니다. 사용자 지정 허용오차 클래스를 생성하려면 matlab.unittest.constraints.Tolerance에서 클래스를 파생하고 모든 추상 메서드를 구현하십시오.

클래스 특성

Abstract
true

클래스 특성에 대한 자세한 내용은 클래스 특성 항목을 참조하십시오.

메서드

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예제

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스크립트 열기

두 DNA 염기 서열의 해밍 거리가 지정된 허용오차 내에 있는지 확인합니다. 길이가 동일한 두 DNA 염기 서열의 경우 해밍 거리는 두 서열에서 뉴클레오티드(문자)가 서로 다른 위치의 개수입니다.

DNA 클래스 만들기

DNA 염기 서열을 표현하기 위해 현재 폴더에 있는 DNA.m이라는 파일에서 DNA 클래스를 만듭니다.

classdef DNA
    properties (SetAccess=immutable)
        Sequence char {mustHaveValidLetters}
    end

    methods
        function dna = DNA(sequence)
            dna.Sequence = sequence;
        end
    end
end

function mustHaveValidLetters(sequence)
validLetters = ...
    sequence == 'A' | ...
    sequence == 'C' | ...
    sequence == 'T' | ...
    sequence == 'G';

if ~all(validLetters,"all")
    error("Sequence contains one or more invalid letters.")
end
end

HammingDistance 클래스 만들기

현재 폴더에 있는 HammingDistance.m이라는 파일에서 matlab.unittest.constraints.Tolerance를 서브클래스로 만들어 HammingDistance 클래스를 만듭니다. 허용 가능한 최대 해밍 거리를 지정할 수 있도록 Value 속성을 추가합니다.

Tolerance 클래스에서 파생되는 클래스는 supports, satisfiedBy, getDiagnosticFor 메서드를 구현해야 합니다.

  • supports 메서드 — 허용오차가 DNA 클래스의 객체를 지원해야 함을 지정합니다.

  • satisfiedBy 메서드 — 실제 값과 예상 값이 허용오차 내에 있도록 지정합니다. 두 값은 크기가 같아야 하고 해밍 거리가 허용오차 값보다 작거나 같아야 합니다.

  • getDiagosticFor 메서드 — 비교에 대한 진단 정보가 포함된 StringDiagnostic 객체를 생성하고 반환합니다.

classdef HammingDistance < matlab.unittest.constraints.Tolerance
    properties
        Value
    end

    methods
        function tolerance = HammingDistance(value)
            tolerance.Value = value;
        end

        function tf = supports(~,expected)
            tf = isa(expected,"DNA");
        end

        function tf = satisfiedBy(tolerance,actual,expected)
            if ~isSameSize(actual.Sequence,expected.Sequence)
                tf = false;
                return
            end
            tf = hammingDistance(actual.Sequence,expected.Sequence) <= ...
                tolerance.Value;
        end

        function diagnostic = getDiagnosticFor(tolerance,actual,expected)
            import matlab.unittest.diagnostics.StringDiagnostic
            if ~isSameSize(actual.Sequence,expected.Sequence)
                str = "The DNA sequences have different lengths.";
            else
                str = "The DNA sequences have a Hamming distance of " ...
                    + hammingDistance(actual.Sequence,expected.Sequence) ...
                    + "." + newline + "The allowable distance is " ...
                    + tolerance.Value + ".";
            end
            diagnostic = StringDiagnostic(str);
        end
    end
end

function tf = isSameSize(str1,str2)
tf = isequal(size(str1),size(str2));
end

function distance = hammingDistance(str1,str2)
distance = nnz(str1 ~= str2);
end

DNA 염기 서열 비교하기

허용오차를 사용하여 DNA 염기 서열을 비교하려면 먼저 필요한 클래스를 가져오고 대화형 방식 테스트를 위한 테스트 케이스를 만드십시오.

import matlab.unittest.TestCase
import matlab.unittest.constraints.IsEqualTo
testCase = TestCase.forInteractiveUse;

DNA 객체를 두 개 만들고 허용오차를 지정하지 않은 채로 이들을 비교합니다. 객체가 동일하지 않으므로 테스트가 실패합니다.

sampleA = DNA("ACCTGAGTA");
sampleB = DNA("ACCACAGTA");
testCase.verifyThat(sampleA,IsEqualTo(sampleB))

Verification failed.
    ---------------------
    Framework Diagnostic:
    ---------------------
    IsEqualTo failed.
    --> ObjectComparator failed.
        --> The objects are not equal using "isequaln".
        
        Actual Value:
          DNA with properties:
        
            Sequence: 'ACCTGAGTA'
        Expected Value:
          DNA with properties:
        
            Sequence: 'ACCACAGTA'
    ------------------
    Stack Information:
    ------------------
    In C:\work\CreateCustomToleranceExample.m (CreateCustomToleranceExample) at 45

해밍 거리 1 내에서 DNA 염기 서열이 동일한지 확인합니다. 테스트가 실패하고 테스트 프레임워크는 getDiagnosticFor 메서드로 생성된 추가 진단 정보를 표시합니다.

testCase.verifyThat(sampleA,IsEqualTo(sampleB,"Within",HammingDistance(1)))

Verification failed.
    ---------------------
    Framework Diagnostic:
    ---------------------
    IsEqualTo failed.
    --> ObjectComparator failed.
        --> The objects are not equal using "isequaln".
        --> The DNA sequences have a Hamming distance of 2.
            The allowable distance is 1.
        
        Actual Value:
          DNA with properties:
        
            Sequence: 'ACCTGAGTA'
        Expected Value:
          DNA with properties:
        
            Sequence: 'ACCACAGTA'
    ------------------
    Stack Information:
    ------------------
    In C:\work\CreateCustomToleranceExample.m (CreateCustomToleranceExample) at 51

해밍 거리 2 내에서 DNA 염기 서열이 동일한지 확인합니다. 테스트가 통과합니다.

testCase.verifyThat(sampleA,IsEqualTo(sampleB,"Within",HammingDistance(2)))

Verification passed.

버전 내역

R2013a에 개발됨

참고 항목

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